牛津大学共有38个学院, 以书院联邦制形式组成了牛津大学。牛津大学玛格丽特夫人学院始建于1878年，是牛津大学历史上的第一所女子学院。学院以英国国王亨利七世的生母玛格丽特·波弗特夫人(Lady Margaret Beaufort)命名。从1979年起，学院开始招收男生。玛格丽特夫人学院和牛津大学圣安妮学院(St. Anne's College)一起成为牛津历史上第一批实行男女混合教育的女子学院。英国著名演员艾玛·沃特森Emma Waston（电影《哈利·波特》选中饰演赫敏·格兰杰）和本尼迪克特·康伯巴奇（Benedict Cumberbatch）（主演电视剧《神探夏洛克》系列剧集）曾是该学院的访问学者。

允许学生以正式注册的牛津大学生身份进行学期或学年的学习。

2018年起，牛津大学玛格丽特夫人学院开始对部分中国重点高校开放优秀本科生海外学生项目，非重点高校但非常优秀的学生也可申请。1-2名，但是获我校提名的学生不代表被该项目录取，最终入选项目的学生名单由牛津大学选拔决定。